区域属暖温带季风型大陆性气候。其特点是：一年四季分明，春季（3—5月）气温逐月递升，由寒转暖，升温快、日差大、多风沙、少雨水、气候干燥；夏季（6—8月）炎热多雨，气温偏高，降水量占年降水量的53%左右，易出现大风、雷雨、冰雹等灾害性天气；秋季（9—11月）由温趋凉，昼夜温差大；冬季（12—2月）干冷少雨雪，降水量只占全年降水量的4%，盛刮西北风。四季昼夜时间有差异，春秋二季昼夜时间基本相等，夏季昼长夜短，冬季昼短夜长。多年平均气温16.5℃，1月份平均气温为1.4℃，极端低温为-18.8℃（1955年1月3日）。7月份平均气温为27.7℃，极端高温为42.6℃（1972年7月1日）。平均气温年较差为4.4℃。年平均无霜期226天。年平均日照2094小时。年平均总辐射113.77千卡/平方厘米。年平均降水量755.7毫米，年平均降水日数为91.3天。极端年最大雨量1323.6毫米（1964年），极端年最小雨量373.9毫米（1966年），降雨量集中在每年6月至8月，7月最多。

境内河道属淮河流域沙颍河水系，主要河道有三级河湛河1条；四级河5条（西杨村河、陈庄沟、稻田沟、香山沟、温集沟）。境内最大的河流为湛河，发源于滍阳镇马跑泉，呈西北—东南方向，流经境内焦店镇、市区，东入卫东区境内，最后注入淮河支流沙河，全长42.3公里，流域面积26.5平方公里。主要支流有西杨村河、陈庄沟、稻田沟、香山沟、温集沟等。